jueves, 8 de mayo de 2014

ANÁLISIS DE EXPERIMENTOS EN PARCELAS DIVIDIDAS CON “R”

ANÁLISIS DE EXPERIMENTOS EN PARCELAS DIVIDIDAS CON “R”
Ing. Luis Manfredo Reyes

Aunque en la literatura muchos autores lo consideran un diseño aparte, en realidad Parcelas Divididas es un arreglo especial  de tratamientos de un experimento factorial.

En un factorial tradicional se combinan los niveles “todos contra todos”, mientras que en parcelas divididas,  se define una “parcela grande” que contiene los niveles del factor A, y dentro de ella se definen las “parcelas chicas” que contienen los niveles del factor B.

La principal justificación del uso de éste arreglo es por manejo del experimento, pues comparada con el diseño tradicional se pierde precisión en la parcela grande, además de que existen dos errores que deben ser considerados.


El objetivo de éste artículo no es profundizar en los detalles del análisis manual del diseño, sino definir cómo se realiza en el paquete estadístico R. R es actualmente el programa estadístico más utilizado en el mundo académico y de investigación, primero por su potencia de procesamiento, y en segundo lugar por ser un software libre.

R no posee en forma nativa manera  de analizar los datos de un parcelas divididas, pero afortunadamente se tienen  muchos agregados que facilitan muchas tareas específicas.

Una de las contribuciones que existe, es el paquete “AGRICOLAE”, que fue escrito por Felipe de Mendiburu de Perú  como una tesis de posgrado. En éste paquete sí existen medios para poder analizar los datos.
Se asume que los lectores tienen conocimientos de cómo se utiliza el programa R
Ejemplo: ( fuente: Manual de Agricolae)
Factores: 2
Factor A: niveles 2
Factor B: niveles 3
Diseño: bloques al azar, con tres repeticiones
Existen 6 parcelas grandes, identificadas arbitrariamente como p1,p2,p3,p4,p5,p6 dos en cada bloque
En R existen muchas formas de ingresar datos, siendo una muy utilizada crear un archivo de texto como éste: (nombre del archivo: PARCELA.TXT)
En la primera columna está el número de bloque
En la segunda la identificación de parcela
En la tercera el nivel del factor A
En la cuarta el nivel del factor B
En la quinta, la variable respuesta  (rendimiento)
El archivo se puede generar en el bloc de notas, o en Excel y luego convertirlo a texto.


Procedimiento para el análisis
1.       Cargar la librería agricolae
Library agricolae  (enter)
2.       Leer el archivo de datos y almacenarlo en un objeto llamado “datos” (puede ser cualquier nombre)
El archivo debe estar en el directorio donde R lee y graba datos, de lo contrario se debe definir toda la ruta de acceso
datos <-read.table(“parcelas.txt”,header=TRUE)    (enter)
la opción header=TRUE le indica al programa que en la primera fila se encuentran los nombres de las variables
3.       Definir las variables independientes (factores)
Datos[,1] <-as.factor(datos[,1])
4.       Calcular el andeva y almacenar en el objeto “modelo”
modelo <-aov(rdto~bloque+A*B+Error(parcela),data=datos)
5.       Presentar los datos del análisis
summary(modelo)
6.       Extraer información necesaria para completar el análisis
gl.error.a <-modelo$parcela$.df.residual
gl.error.b <-modelo$Within$df.residual
x <-modelo$parcela$residuals
y <-modelo$Within$residuals
sc.error.a <-sum(x^2)
sc.error.b <-sum(y^2)
cm.a <-sc.error.a/gl.error.a
cm.b <-sc.error.b/gl.error.b
7.       Calcular el promedio general del experimento
attach(datos)
promedio <-mean(rdto)
8.       Determinar cuántos niveles tienen los factores
a<-lenght(levels(A))
b <-lenght(levels(B))
9.       Calcular los coeficientes de variación
cv.a <-sqrt(cn.a/b)*100/promedio
cv.b. <-sqrt(cm.b)*100/promedio

10.   Prueba de Tukey a los factores
Compara.a <-HSD.test(rdto,”A”,gl.error.a,cm.error.-a,group=TRUE)
Compara.b <-HSD.test(rdto,”B”,gl.error.b,cm.error.-b,group=TRUE)
11.   Presentar resultados
Summary(modelo)
Los resultados son los siguientes:





Los créditos del paquete Agricolae  son los siguientes:


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